| 種 別 | 番号 | 名 称 | 時 代 | 所 在 地 | 管 理 者 |
| 考 古 資 料 | 1 | 石枕 | 古 墳 | 今泉町 | 個 人 |
| 2 | 籠目のついた壷 | 古 墳 | 真鍋一丁目 | 霞ヶ浦学園 | |
| 3 | 板碑 | 安土桃山〜江戸 | 田 宮 | 個 人 | |
| 4 | 板碑・六字名号塔 | 江 戸 | 高 岡 | 法雲寺 | |
| 5 | 坩渦 | 中 世 | 藤 沢 | 土浦教育委員会 | |
| 6 | 板碑・二十三夜尊供養の塔 (慶長12年銘) |
江 戸 | 高 岡 | 個 人 | |
| 7 | 板碑・二十三夜尊供養の塔 (寛永6年銘) |
江 戸 | 藤 沢 | 東町区 | |
| 8 | 東城寺結界石 | 鎌 倉 | 東城寺 | 個 人 | |
| 9 | 板碑・御湯殿山時念仏天長地久二世安楽供養塔 | 江 戸 | 田 宮 | 梶ノ宮神社 | |
| 10 | 板碑・六字名号塔 | 江 戸 | 田 宮 | 土浦教育委員会 | |
| 11 | 板碑・六字名号塔 | 江 戸 | 高 岡 | 高岡根区 | |
| 12 | 重圏文鏡 | 古 墳 | 下坂田 | 個 人 | |
| 13 | 石造阿弥陀種子板碑 | 鎌 倉 | 宍塚町 | ||
| 歴 史 資 料 | 1 | 算額 | 江 戸 | 中央二丁目 | 瀧泉寺 |
| 2 | 傘式地球儀 | 江 戸 | 真鍋五丁目 | 個 人 | |
| 3 | 渾天儀 | 江 戸 | 真鍋五丁目 | 個 人 | |
| 4 | 関の鉄砲(大筒・小筒) | 江 戸 | 西真鍋町 | 個 人 | |
| 5 | 渾天儀 | 江 戸 | 飯田町 | 個 人 | |
| 6 | 土浦城櫓門の太鼓 | 江 戸 | 川口(1・2丁目)公民館 | 三社奉賛会 | |
| 7 | 土浦道中絵図 | 江 戸 | 真鍋一丁目 | 個 人 | |
| 8 | 傘式大輿地球儀 | 江 戸 | 市立博物館 | 江 戸 | |
| 9 | 坤輿万国全図 | 江 戸 | 市立博物館 | 土浦教育委員会 | |
| 10 | 色川三中文庫(74種) | 江 戸 | 市立博物館 | 土浦教育委員会 | |
| 11 | 地球万国図説。書冊(自筆本) | 江 戸 | 市立博物館 | 土浦教育委員会 | |
| 有形民俗文化財 | 1 | 土浦町内祇園祭礼式真図 | 江 戸 | 中央一丁目 | 個 人 |
| 2 | 不動院力石(2個) | 江 戸 | 中央一丁目(不動院) | 瀧泉寺 | |
| 3 | 鷲神社力石(3個) | 江 戸 | 東崎町(鷲神社) | 鷲神社氏子総代 | |
| 4 | 水天宮力石(2個) | 江 戸 | 川口二丁目(水天宮) | 三社奉賛会 | |
| 5 | 煙火筒 | 近 代 | 高 岡 | 鹿島神社 | |
| 6 | 鷲大神宮座文書(4通) | 江 戸 | 田村町 | 田村町16人当 | |
| 7 | 土浦祭礼の図 | 江 戸 | 市立博物館 | 土浦教育委員会 | |
| 無形民俗文化財 | 1 | 上高津大杉ばやし | - | 上高津(大杉神社) | 上高津大杉ばやし保存会 |
| 3 | 菅谷ばやし | - | 菅谷町 | 菅谷ばやし 保存会 |
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| 4 | 盆綱 | - | 佐野子町 | 佐野子町地区長 | |
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市指定文化財 5/7
平成18年 4月 1日 現在